Ndeti đã có một sự nghiệp khác nhau trong quản lý kinh doanh kéo dài đến năm 2007, khi cô phục vụ trong một năm, với tư cách là phó chủ tịch của khu vực công ty của tổ chức sinh viên AIESEC. Sau đó, cô phục vụ như là điều phối viên quốc gia cho Đội ngũ Huấn luyện viên cho tổ chức, trong một năm nữa.[4]

Sau khi thành lập với hai công ty địa phương, tại Nairobi, cô đồng sáng lập và làm giám đốc của Gregos Food Limited, một doanh nghiệp ẩm thực Kenya. Vào tháng 6 năm 2015, cô được thuê làm điều phối viên khu vực cho Đông Phi của ANDE, Mạng lưới các doanh nhân phát triển Aspen tại Viện Aspen. ANDE là một mạng lưới toàn cầu của các tổ chức hỗ trợ tinh thần kinh doanh tại các thị trường mới nổi.[4]

Vào tháng 2 năm 2017, Esther được bổ nhiệm làm Giám đốc điều hành của EVCA, chịu trách nhiệm cho (a) thành viên (b) kết nối (c) đào tạo (d) sáng kiến kinh doanh (e) quan hệ đối tác chiến lược và (f) quan hệ truyền thông.[1]